Rencontre de septembre 2025: Premiers pas avec {targets} : développer des pipelines R reproductibles
Rencontres
La prochaine rencontre de R-Toulouse est prévue le jeudi 25 septembre 2025 de 17h00 à 18h00, dans l’auditorium du Centre de Biology Integrative de Toulouse (métro Université Paul Sabatier, ligne B).
La salle sera accessible à toutes et tous sur inscription, il faudra se présenter à l’accueil du bâtiment. Des pancartes R Toulouse seront idéalement placées pour vous guider.
** Attention** : pour des raisons de sécurité, l’inscription à ces rencontres est obligatoire pour pouvoir entrer au CBI: https://evento.renater.fr/survey/presence-a-r-toulouse-le-25-09-2025-d0467vv7
Programme
Premiers pas avec {targets} : développer des pipelines R reproductibles, par Cervin Guyomar d’INRAE Toulouse.
Dans cet exposé, j’aborderai le package {targets}, un gestionnaire de pipelines “make like” en R. Plutôt qu’une présentation exhaustive, je partagerai mon retour d’expérience lors de la mise en place d’un premier pipeline d’analyse bioinformatique. J’illustrerai les bénéfices concrets que j’y ai trouvés par rapport à mes outils habituels, notamment en matière de reproductibilité et de passage à l’échelle.
